一、 剪鼠尾
1. 剪鼠尾的时间 当新生的小鼠年龄达到两到三周(耳朵已经长开)时剪鼠尾较好,
此时鼠尾剪起来比较容易且小鼠的生命力比较强。 2. 分辨小鼠的年龄
a当小鼠整个身体较红且腹部无奶时,此小鼠当天出生或前一晚出生;
b当小鼠腹部有奶(腹部有一小团白色物质),此小鼠出生2~3天; c当小鼠背部长出皮毛时,此小鼠出生3~4天;
d当小鼠毛长全,但眼未开时,此小鼠出生10天左右; e当小鼠眼刚开,耳未开时,此小鼠出生12天左右; f当小鼠耳刚开时,此小鼠出生14天左右。 3. 剪鼠尾后对小鼠的标记 :打耳孔法 二、 从鼠尾中提取DNA
采用鼠尾基因组DNA提取试剂盒(康为世纪:cw2094)提取DNA,操作如下: 1. 剪取小鼠长度为0.4-0.6cm的尾巴,放入灭菌后的离心管中,加入180μL Buffer GTT。震荡混匀。
2. 加入20μL proteinase K,涡旋震荡,彻底混匀。
3. 置于56℃水浴,直到组织溶液完全清澈,一般需消化6-8h,赋予过程中涡旋震荡,使样品均匀分离。 注意:
1) 如果赋予和涡旋震荡后仍然有胶状物质,必要时过夜消化再加入20μl proteinase K消化,不会影响后续操作。
2) 如需去除RNA,可在上述步骤完成后,加入4μl浓度为100mg/μl的RNase A溶液,震荡混匀,室温放置5-10min。
4. 14000rpm 离心 1min,以消除未消化的类似于鼠毛等组织,将上清转移到一个新的灭过菌的离心管中。
5. 加入200μl Buffer GL,涡旋震荡,充分混匀,加入200μl 无水乙醇,涡旋振荡,充分混匀,短暂离心,使管壁上的溶液收集到管底。 注意:
1)加入Buffer GL 和无水乙醇后要立即涡旋震荡混匀。
2) 如果多个样品一起操作,Buffer GL 和无水乙醇可以等比例混匀后一起加入样品。
3)加入Buffer GL 和无水乙醇后可能会产生白色沉淀,不会影响后续操作。 6. 将步骤5中所得到的溶液全部加入到已装入收集管的吸附柱中,若以此不能加完溶液,可分多次转入。10000rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
7. 向吸附柱中加入 500μl Buffer GW1(使用前检查是否已加无水乙醇),10000 rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 8. 向吸附柱中加入 500μl Buffer GW2(使用前检查是否已加无水乙醇),10000 rpm 离心 1min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。如需进一步提高DNA纯度,可重复步骤8。
9. 12000rpm 离心 2min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾
干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切,PCR等)。
10. 将吸附柱置于一个新的灭过菌的离心管中,向吸附柱的中间部位悬空加入50-200μl Buffer GE或灭菌水,室温放置2-5min,10000rpm 离心 1min,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。 注意:
1)如果下游实验对PH值或EDTA敏感,可以用灭菌水洗脱,洗脱液的PH值对洗脱效率有很大影响,若用水作洗脱液应保证其PH值在7.0-8.5直接,PH值低于7.0时洗脱效率不高。
2)离心前室温孵育5min可增加产量。
3)用另外的50-200μL Buffer GE或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
4)如果需要提高DNA的终浓度,可以将步骤10所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤10;若洗脱体积小于200μL,可以增加DNA的终浓度,但可能会减少总产量。 三、 PCR PCR程序设定:
1= 94.0℃ for 5:00 2= 94.0℃ for 1:00 3= 59.0℃ for 0:50 4= 72.0℃ for 1:00 5= Goto 2 2times 6= 94℃ for0:50 7= 58℃ for 0:50 8=72℃ for 1:00 9=Goto 6 2times 10= 94.0℃ for 0:50 11=56.0℃ for 0:50 12= 72.0℃ for 1:00 13= Goto10 32times 14= 72.0℃ for 10:00 15= 4.0℃ for 5:00 16=END
目前实验室的双转基因小鼠AD体系采用: PCR反应的体系(12μl):APP
Primer APP-1 1.3μl Primer APP-2 1.3μl ddH2O 2μl mix(CW0682) 6μl DNA 1μl
PCR反应的体系(12μl):PS1
Primer PS1-1 1.3μl Primer PS1-2 1.3μl 内参-1 1μl 内参-2 1μl
mix(CW0682)6μl DNA 1μl
先在1.5ml的EP管中加入总的体系再平均分装入各个PCR管中(一般多加两小管的量),将移液器调到总量的1/3到1/2体积在EP管中缓慢抽吸若干次(尽量避免产生气泡)以便Taq酶混合均匀,最后再在各PCR管中依次加入DNA样品。
引物处理方法:引物在安基生物有限公司合成后,EP管上会有标记,一般为x nmol,使用前先用12000rpm 离心 1min,加入10x μl ddH2O,涡旋振动混匀,微型离心机离心,即可得到100μM的母液,取10μl 的母液,用ddH2O稀释10倍,即加入90μl,混匀后即可得到10μM的引物工作液。 四、 电泳
1. 配胶:鉴定用的胶板有大、中、小3种,分别用的梳子为50、25、11齿。分别用的0.5*TBE的量为90ml、45ml、25ml。用1.5%的琼脂糖凝胶。
2. 点样:12μl的DNA,Marker加5μl。点样时注意逐个点样,不要点错,最好把中间的那个孔留着点Marker,这样可避免点样的出错。Marker的选择依基因片段大小而定。
3. 跑电泳:打开电源,150v电压,30min左右即可。
4. 照胶:看是否有目的条带,即可判断对应小鼠是阳性、阴性或是杂合子。 5. 保存。
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