论文引用文献的上标应该放在句号前。参考文献的上标，即引用脚注或尾注，是对文本的补充说明。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释；尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。既然作为对文本的说明，则应该放在所说明文本处，即在句号前。
按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T7714-2015《信息与文献参考文献著录规则》”的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。根据《某国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《某国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。交叉引用于文中时置于句号前。
论文引用文献的上标是在句号前还是句号后。论文引用文献的上标是句号前还是句号后，要看这一句话是在句中还是句未了。
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