DNA测序（同义词：DNA深度测序| DNA⾼通量测序）包括全基因组测序（WGS），全外显⼦组测序（WES或WXS）和靶向测序。WGS意味着对整个DNA基因组进⾏测序，
⽽WES专注于mRNA编码区（外显⼦）进⾏测序，⽽mRNA编码区（外显⼦）通常只占很⼩的基因组部分（在⼈类中为3％）。尽管WGS和WES都可以⽤来发现与疾病或表型相关的罕见突变/常见变异，但WES的价格却⽐WGS便宜得多且速度更快。靶向测序仅关注⽬标基因（或⽬标区域）的⼦集，是最快，最便宜的DNA测序类型。
RNA测序（同义词：RNA深度测序| RNA⾼通量测序）
包括全转录组测序（WTS），mRNA测序（mRNA-seq）和⼩RNA测序（smRNA-seq）。与DNA-seq不同，RNA-seq需要先将提取的RNA反转录为cDNA，然后再进⾏扩增。
RNA测序最常见的应⽤是检测基因表达的变化，可变剪接，转录后修饰，基因融合，也可以检测突变和SNP。
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