蛋白质三维结构的预测方法

（12）发明专利申请

（21）申请号 CN200710098715.5 （22）申请日 2007.04.25

（71）申请人 中国医学科学院基础医学研究所

地址 100005 北京市东单三条5号

（10）申请公布号 CN101294970A

（43）申请公布日 2008.10.29

（72）发明人 唐鹤云;张正国;杨啸林;郭亚峰 （74）专利代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司

代理人 程伟

（51）Int.CI

G01N35/00; G06F19/00;

权利要求说明书 说明书 幅图

（54）发明名称

蛋白质三维结构的预测方法

（57）摘要

本发明提供了一种预测蛋白质三维结构的

方法。该方法通过1)将要预测三维结构的目标蛋白质序列中的一个氨基酸(例如第一个)设定预测坐标值，2)以1)中的下一个氨基酸(例如第二个)为中央氨基酸在目标序列中分割一个九肽片段，3)在九肽片段数据库中搜索与步骤2)的序列最佳匹配的九肽片段，4)根据搜索出的最佳匹配片段

的中央氨基酸的相对坐标计算目标九肽片段中央氨基酸的坐标，将其装配到目标蛋白上，5)以目标序列的下一个氨基酸(例如第三个)作为下一个中央氨基酸重复进行上述的分割、搜索、装配步骤，直至最后一个氨基酸装配结束。该方法获得的目标蛋白质序列结构具有较好的精度，解决了侧链安置问题，运算量小，计算速度快。

法律状态

法律状态公告日2008-10-29 2008-10-29 2010-05-05 2010-05-05 2012-12-05 2012-12-05 2019-04-12

法律状态信息

公开 公开

实质审查的生效 实质审查的生效 授权 授权 专利权的终止

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权利要求说明书

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说明书

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