基于分子动力学模拟研究pH对抗菌肽LL-37结构的影响

中国抗生素杂志２０１５年４月第４０卷第４期　２４５　文章编号：１００１—８６８９（２０１５）０４—０２４５—０６　基于分子动力学模拟研究ｐＨ对抗菌肽ＬＬ．３７结构的影响　彭冉１，２赵立岭－　曹赞霞　王吉华　，　（１山东省功能大分子生物物理重点实验室，德州学院物理与电子信息学院，德州２５３０２３　２山东师范大学物理与电子科学学院，济南２５００１４）　摘要：目的　研究溶液ｐＨ变化对抗菌肽ＬＬ一３７结构的影响。方法　利用分子动力学模拟方法，采用ＧＲＯＭＡＣＳ软件包和　ＯＰＬＳ—ＡＡ力场，分别在中性和强碱性条件下对ＬＬ一３７进行模拟，总模拟时间达１微秒，最后对模拟轨迹进行分析处理。结果　ＬＬ．３７在中性环境下具有部分螺旋结构存在，特别是Ｎ端部分残基，结构具有较大柔性；在强碱性环境下，螺旋含量增多，抗菌　核心区域残基形成螺旋结构的几率明显增大，结构稳定性增强。结论　ｐＨ值的增大会促进ＬＬ一３７螺旋结构的形成，螺旋结构的　形成和与膜结合是协同的。Ｎ端残基易形成螺旋，然后是抗菌核心区域。ＬＬ－３７在中性环境下的结构特征与其行使多功能的角色　相一致。该研究首次分析ＴＬＬ．３７在中性环境下的结构特征及ｐＨ的影响，有助于认识其抗菌机制及新药设计。　关键词：分子动力学模拟；抗菌肽；ＬＬ一３７；Ｑ一螺旋结构　中图分类号：Ｑ６１７，Ｑ５１　文献标志码：Ａ　Ｔｈｅ　ｅｆｆｅｃｔ　ｏｆ　ｐＨ　ｖａｌｕｅ　ｏｎ　ｔｈｅ　ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌ　ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ　ｏｆ　ｔｈｅ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７　ｓｔｕｄｉｅｄ　ｂｙ　ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｄｙｎａｍｉｃｓ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎｓ　Ｐｅｎｇ　Ｒａｎ‘－一，Ｚｈａｏ　Ｌｉ—ｌｉｎｇ　，Ｃａｏ　Ｚａｎ—ｘｉａ　ａｎｄ　Ｗａｎｇ　Ｊｉ－ｈｕａ　（１　Ｓｈａｎｄｏｎｇ　Ｐｒｏｖｉｎｃｉａｌ　Ｋｅｙ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ　ｏｆ　Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ　Ｍａｃｒｏｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｂｉｏｐｈｙｓｉｃｓ，Ｃｏｌｌｅｇｅ　ｏｆ　Ｐｈｙｓｉｃｓ　ａｎｄ　Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ　ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ，　Ｄｅｚｈｏｕ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｄｅｚｈｏｕ　２５３０２３；２　Ｃｏｌｌｅｇｅ　ｏｆ　Ｐｈｙｓｉｃｓ　ａｎｄ　Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃｓ，Ｓｈａｎｄｏｎｇ　Ｎｏｒｍａｌ　Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｊｉｎａｎ　２５００　１　４）　Ａｂｓｔｒａｃｔ　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ　Ｔｏ　ｓｔｕｄｙ　ｔｈｅ　ｅｆｆｅｃｔ　ｏｆ　ｓｏｌｕｔｉｏｎ　ｐＨ　ｏｎ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ　ｏｆ　ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａ１　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７．Ｍｅｔｈｏｄｓ　Ｂａｓｅｄ　ｏｎ　ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｄｙｎａｍｉｃｓ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎｓ，ＬＬ．３７　ｈａｄ　ｂｅｅｎ　ｓｉｍｕｌａｔｅｄ　ｗｉｔｈ　ＧＲＯＭＡＣＳ　ｓｏｆｔｗａｒｅ　ｐａｃｋａｇｅ．ＯＰＬＳ．ＡＡ　ｆｏｒｃｅ　ｆｉｅｌｄ　ａｎｄ　ＴＩＰ４Ｐ　ｗａｔｅｒ　ｍｏｄｅｌ　ｕｎｄｅｒ　ｎｅｕｔｒａ１　ｓｏｌｕｔｉｏｎ　ａｎｄ　ｓｔｒｏｎｇ　ａｌｋａｌｉｎｅ　ｓｏｌｕｔｉｏｎ，　ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ　ｔｉｍｅ　ｗａｓ　ｕｐ　ｔｏ　１　ｍｉｃｒｏｓｅｃｏｎｄ　ａｎｄ　ｔｈｅ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ　ｔｒａｊｅｃｔｏｒｉｅｓ　ｗｅｒｅ　ａｎａｌｙｚｅｄ．Ｔｈｅ　ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌ　ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ　ｗｅｒｅ　ｐｉｃｔｕｒｅｄ　ｂｙ　ｔｈｅ　ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ　ｏｆ　ｓｅｃｏｎｄａｒｙ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｆｏｒｍａｔｉｏｎ，ｒｏｏｔ　ｍｅａｎ　ｓｑｕａｒｅ　ｌｕｃｔｕａｔｉｏｎ　ｏｆ　ａｔｏｍｓ　ａｎｄ　ｃｏｎｔａｃｔｆ　ｂｅｔｗｅｅｎ　ｒｅｓｉｄｕｅｓ．Ｒｅｓｕｌｔｓ　ＬＬ．３７．ｅｓｐｅｃｉａｌｌｙ　ｉｔｓ　Ｎ—ｔｅｒｍｉｎａｌ　ｒｅｓｉｄｕｅｓ　ｏｆ　ＬＬ一３７　ｆｏ．ｒｍｅｄ　ｈｅｌｉｃａｌ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ　ｕｎｄｅｒ　ｎｅｕｔｒａｌ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ，ａｎｄ　ｔｈｅ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ　ｈａｄ　ｈｉｇｈ　ｆｌｅｘｉｂｉｌｉｔｙ．Ｕｎｄｅｒ　ｓｔｒｏｎｇ　ａｌｋａｌｉｎｅ　ｃｏｎｄｉｔｉｏｎ．ｔｈｅ　ｈｅｌｉｃａｌ　ｃｏｎｔｅｎｔ　ｉｎｃｒｅａｓｅｄ　ａｎｄ　ｔｈｅ　ｐｏｓｓｉｂｉｌｉｔｙ　ｆｏｒ　ｒｅｓｉｄｕｅｓ　ｌｏｃａｔｅｄ　ａｔ　ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ　ｃｏｒｅ　ｒｅｇｉｏｎ　ｔｏ　ｆｏｒｍ　ｈｅｌｉｃａ１　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｗａｓ　ｓｉｇｎｉｉｃａｎｔｌｙ　ｉｆｎｃｒｅａｓｅｄ．Ａｔ　ｔｈｅ　ｓａｍｅ　ｔｉｍｅ，ｔｈｅ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｓｔａｂｉｌｉｔｙ　ｗａｓ　ａｌｓｏ　ｅｎｈａｎｃｅｄ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ　Ｆｏｒ　ＬＬ一３７．ｔｈｅ　ｉｎｃｒｅａｓｅ　ｏｆ　ｐＨ　ｖａｌｕｅ　ｃａｎ　ｐｒｏｍｏｔｅ　ｔｈｅ　ｆｏｒｍａｔｉｏｎ　Ｏｆ　ＬＬ一３７　ｈｅｌｉｃａｌ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ．Ｔｈｅ　ｆｏｒｍａｔｉｏｎ　Ｏｆ　ＬＬ一　３７　ｈｅｌｉｃａｌ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ａｎｄ　ｍｅｍｂｒａｎｅ　ｂｉｎｄｉｎｇ　ｉｓ　ｃｏｌｌａｂｏｒａｔｉｖｅ．Ｔｈｅ　ｒｅｓｉｄｕｅｓ　ｌｏｃａｔｅｄ　ａｔ　Ｎ　ｔｅｒｍｉｎａ１　ａｒｅ　ｍｏｒｅ　ｐｒｏｎｅ　ｔｏ　ｆｏ．ｒｉｌｌ　ａ　ｈｅｌｉｃａｌ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｔｈａｎ　ｏｔｈｅｒｓ　ａｎｄ　ｆｏｌｌｏｗｅｄ　ｂｙ　ｔｈｅ　ｒｅｓｉｄｕｅｓ　ｌｏｃａｔｅｄ　ａｔ　ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ　ｃｏｒｅ　ｒｅｇｉｏｎ．Ｔｈｅ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ　ｏｆ　ＬＬ．３７　ｕｎｄｅｒ　ｎｅｕｔｒａ１　ｓｏｌｕｔｉｏｎ　ａｒｅ　ｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔ　ｗｉｔｈ　ｉｔｓ　ｍｕｌｔｉｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ　ｒｏｌｅ．Ｔｈｉｓ　ｗｏｒｋ　ｄｉｓｃｕｓｓｅｓ　ｔｈｅ　收稿日期：　２０１４—１０．０８　Ｎｏ．６１２７１３７８，Ｎｏ．３１０００３２４￣Ｎｏ　３０９７０５６１）￣山东自然科学基金（Ｎｏ．ＺＲ２０１４ＡＬ０１４）　基金项目：　国家自然科学基金（ｌ：ｐｅｎｇｒａｎｓｄｎｕ＠１２６．ｔｏｍ　作者简介：　彭冉，女，生于１９８９年，在读硕士研究生，主要从事计算生物学研究，Ｅ—ｍａｉ通讯作者，　Ｅ—ｍａｉｌ：ｊｈｗ２５３３６＠ｌ　２６．ｃｏｍ　２４６　基于分子动力学模拟研究ｐＨ对抗菌肽ＬＬ一３７结构的影响彭冉等　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ　ｉｎ　ｎｅｕｔｒａｌ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ　ａｎｄ　ｔｈｅ　ｅｆｆｅｃｔ　ｏｆ　ｐＨ　ｖａｌｕｅ　ｏｎ　ｓｔｕｃｔｒｕｒｅ　ｏｆ　ＬＬ－３７，ｗｈｉｃｈ　ｉｓ　ｉｍｐｏｒｔａｎｔ　ｆｏｒ　ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ　ｔｈｅ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｍｅｃｈａｎｉｓｍ　ｏｆ　ＬＬ－３７　ａｎｄ　ｎｅｗ　ｄｒｕｇ　ｄｅｓｉｇｎ．　Ｋｅｙ　ｗｏｒｄｓ　Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｄｙｎａｍｉｃｓ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ；Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ；ＬＬ－３　７；０【－ｈｅｌｉｘ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　抗菌肽（Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅｓ，ＡＭＰｓ），是一　种小分子多肽。作为宿主防御蛋白，ＡＭＰｓ对保护　动植物等多细胞机体免于感染是必不可少的，不仅　具有杀菌作用，还能抑杀寄生虫、病毒以及肿瘤细　胞，且对正常宿主细胞毒性较小。自上世纪９０年代　始，每年发现的天然抗菌肽数目逐年增多，各种类　型的抗菌肽数据库也有十多个［　】。ＬＬ一３７是抗菌肽　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ家族中唯一存在于人体的抗菌肽，也是人　体内唯一的双亲性ｃ【．螺旋结构的阳离子抗菌肽，以　无活性的前体ｈＣＡＰ．１８形式贮存在中性粒细胞的胞浆　颗粒内。ｈＣＡＰ一１８被蛋白酶裂解后释放出的Ｃ末端结　构域，具有抗菌活性，因具有３７个氨基酸，所以被　称为ＬＬ．３７。近年来，随着抗生素药物的过分使用，　细菌耐药性逐渐增强，越来越多的多药耐药菌被临　床发现。鉴于ＬＬ．３７具有广谱抗菌作用且细菌不易产　生耐药性的特　－３］，引起越来越多的关注【４＿－ｏ］。细菌　细胞膜一般带负电荷，阳离子抗菌肽通过静电吸引　与细菌细胞膜发生作用，从而破坏细菌细胞膜实现　杀菌。在进化过程中，细菌细胞膜的带电属性不易　产生变化，因而细菌对抗菌肽不易产生耐药性…］，　ＡＭＰｓ有望成为新一代抗菌药物。　在微摩尔浓度下，ＬＬ一３７在水溶液中没有稳　定的结构，呈无序状态，属于固有无序蛋白质　（ｉｎｔｒｉｎｓｉｃａｌｌｙ　ｄｉｓｏｒｄｅｒｅｄ　ｐｒｏｔｅｉｎ，ＩＤＰｓ），被收录在无序　蛋白数据库中［　］。在与不同膜结合时，则形成ｈｅｌｉｘ．　ｂｒｅａｋ—ｈｅｌｉｘＥｌ３］或ｈｅｌｉｘ—ｂｅｎｄ—ｈｅｌｉｘｔ　］长螺旋模式。研究　发现【ｌ５］，ＬＬ．３７的螺旋含量与抗菌活性一致，所形　成的螺旋二级结构越多，抗菌活性越强。螺旋二级　结构的形成受诸多因素的影响，如：肽浓度、阴离　子浓度、溶液酸碱性（ｐＨ）等等。其中，随着溶液ｐＨ　的增大，螺旋含量增多。Ｊｏｈａｎｓｓｏｎ等［１５】通过ＣＤ实　验发现，当ｐＨ降低到２～３时，ＬＬ．３７在水溶液中基本　无螺旋形成；而随着ｐＨ的增加，形成螺旋结构的含　量也逐渐增加；当ｐＨ增大到１３时，仍有稳定的螺旋　存在。溶液ｐＨ的变化，会使氨基酸侧链质子化状态　不同，表现为氨基酸带电极性不同，进而影响残基　间的静电相互作用，最终导致局部二级结构发生变　化。ｐＨ的变化会导致哪部分残基易形成螺旋结构？　在水溶液中，ＬＬ．３７的结构是如何随ｐＨ的改变而变化　的？鉴于实验条件的限制，利用现有常规实验手段　还不能对这类问题做出回答。　分子动力学模拟方法利用计算机强大的数值计　算能力，能够模拟生物大分子构象演变的过程，得　到体系变化的瞬间构象，为从原子层面研究蛋白质　及多肽结构特征提供了强有力的工具。本文利用分　子动力学模拟方法，研究了ＬＬ．３７在中性及强碱性环　境下的结构特征，发现ｐＨ变化对螺旋结构的形成有　重要影响；在中性水溶液中，ＬＬ一３７的部分区域会形　成０【　螺旋结构，如具有聚集和免于被蛋白酶降解功　能的Ｎ端残基；而在强碱性环境下，行使抗菌功能的　核心区域也形成稳定的０【一螺旋结构。　１材料和方法　ＬＬ一３７的初始结构取自蛋白质结构数据库（ＰＤＢ　ＩＤ：２Ｋ６０），序列为ＬＬＧＤＦＦＲＫＳＫ　ＥＫＩＧＫＥＦＫＲＩ　ＶＱＲＩＫＤＦＬＲＮ　ＬＶＰＲＴＥＳ。选用ＧＲＯＭＡＣＳ模拟软　件包［１６】、ＯＰＬＳ—ＡＡ力场［１７ＪＳＨＴＩＰ４Ｐ水模型【ｌ８］，研究　ＬＬ．３７在中性和强碱性水溶液环境下的结构特征。在　中性环境下，残基ＡＳＰ￣ＮＧＬＵ分别带单位负电荷，　残基ＬＹＳ和ＡＲＧ分别带单位正电荷，体系带５个净正　电荷。在强碱性环境下，残基ＡＳＰ￣ＷＧＬＵ带单位负　电荷，而残基ＬＹＳ￣ＡＲＧ均不带电，体系带６个净负　电荷。在模拟中，通过对上述残基带电性的不同设　置，分别模拟体系的中性和强碱性环境。　首先，分别将模拟体系放入周期性的截断八面　体盒子中，溶质分子同盒子边缘之间的最小距离设　定为１．０ｎｍ，加入ＴＩＰ４Ｐ型水，选用最陡下降法进　行能量优化，以消除水分子间较高的能量势垒。然　后，对中性和强碱性体系分别加入６个氯阴离子和５　个钠阳离子，替换能量较高的水分子，以保持溶液　的电中性环境。采用同样的能量优化方法，使加入　离子后的体系能量最小。接下来，对体系进行５００皮　秒的位置约束模拟，以平衡肽链、离子和溶剂所组　成的体系，避免后面长时间模拟时出现体系崩溃。　位置约束模拟是保持肽链原子位置近似不变，主要　平衡肽段周围环境。在此期间，采用逐步升温的方　法，将模拟温度升至３００Ｋ，压强选为１×１０５Ｐａ。温　度和压强分别采用ｖ．ｒｅｓｃａｌｅ［１９ｌ￣ｂｅｒｅｎｄｓｅｎ　Ｅ２０］耦合的　方法保持温度和压强不变，耦合时间常数均为０．１皮　秒。选用ＳＨＡＫＥｔ２１１算法约束键长，相对偏差设为　１０～，积分步长为２飞秒。位置约束模拟结束后，再　中国抗生素杂志２０１５ｔｇ４月第４０卷第４期　２４７　对整个体系进行长时间的自由动力学模拟，每２皮　秒输出一次结构，每个体系模拟５００纳秒，总计１微　意味着对ＬＬ一３７而言，免于被蛋白酶降解比其行使功　能更重要。　秒。考虑到初始结构为膜环境下的螺旋结构，每个　体系各选取最后２００纳秒轨迹进行分析。　２结果与讨论　为了解溶液ｐＨ对抗菌肽ＬＬ一３７结构的影响，针对　中性和强碱性环境下模拟得到的构象系综，我们计　图１还表明，即便是在强碱性环境下，ＬＬ一３７的　Ｃ末端残基也没有形成螺旋结构，这与实验结果一　致。二维和三维ＮＭＲ实验证实【　３－１４］，即便是在膜环　境下，ｃ末端残基３１－３７也是无结构的。　为了进一步分析抗菌核心区域ＫＲ一１２形成ａ一螺旋　算了肽链各残基形成二级结构的几率、抗菌核心区　域０【．螺旋结构形成情况、残基间存在接触情况、原　情况，在利用ＳＴＲＩＤＥ软件［２ｚ］计算各残基是否形成ｃ【．　螺旋的基础上，统计了该区域不同长度０【．螺旋的形　子均方根涨落以及聚类得到的代表结构，分析ｐＨ对　肽链二级结构、三级结构及结构分布的影响。　２．１　ｐＨ值对抗菌肽ＬＬ一３７－－－级结构的影响　为了分析ｐＨ值变化对ＬＬ一３７－－级结构形成的影　响，我们用ＳＴＲＩＤＥ软件［２２１分别计算了２组模拟所得　到的构象系综中各残基形成二级结构情况，如图１所　示。模拟轨迹中各残基形成二级结构的几率显示，　首先，在中性和强碱性溶液中，ＬＬ．３７均有一定量的　０【一螺旋结构产生。其次，ＬＬ．３７在强碱性环境下形成　０【一螺旋明显多于中性环境。进一步分析发现，在中　性环境下，残基ｌ６～２３还有一定几率形成３　螺旋，其　中残基１６—１８形成３　螺旋的几率接近５０％，残基２１～２３　形成３．　螺旋的几率大于２０％；在强碱性环境中，则　全部形成仪．螺旋。在上述２种模拟环境下，ＬＬ．３７的Ｃ　末端均没有螺旋产生。　Ｊｏｈａｎｓｓｏｎ等［１５］通过观察ＬＬ一３７在水溶液中的圆二　色光谱发现，当溶液ｐＨ大于３时，存在螺旋结构，　且随着ｐＨ值的增大，０【　螺旋含量增多。图１的模拟　结果与实验观测是一致的。相对于中性环境下残基　肽段１６～２５以一定几率（小于８７％）形成螺旋，在强碱　性环境下，残基肽段２０～２８几乎形成稳定的ａ一螺旋。　众多研究结果证实［Ｈ，ｚ。之　】，残基肽段１　８￣２９（ＫＲ一１２）是　ＬＬ．３７行使抗菌功能最小的片段，被称为核心区域。　模拟结果表明，随着溶液ｐＨ的增大，该核心区域的　．螺旋结构也在增多并趋于稳定。　在２种模拟中，Ｎ端区域残基４～１１（中性）或５～１１（　强碱性１也形成相对稳定的　．螺旋结构。先前研究发　现［１４。ｓ一２５１，Ｎ端结构域（残基１～１３）与抗菌活性无关，　但参与ＬＬ．３７的聚集以抵抗蛋白酶的降解。Ｏｒｅｎ等［２５］　发现，即便是在较低浓度的水溶液中，也有ＬＬ．３７二　聚体的存在。图１中显示了Ｎ端存在螺旋结构，可能　与聚集有关。进一步的证实需要对ＬＬ一３７的二聚体或　三聚体进行模拟分析。在中性环境下，影响聚集的　区域要比抗菌核心区域形成更稳定的螺旋，这可能　成情况，并绘制概率分布图，如图２所示。图中横　坐标为归一化长度，介于０～１之间，０表示ＫＲ一１２的　所有残基都没有形成螺旋，１表示所有残基都处于螺　旋状态。纵坐标为形成相应归一化长度螺旋的构象　在系综中出现的概率，该值越大，表明形成相应长　度螺旋的构象数目越多。图２显示，在中性环境下，　ＫＲ．１２稳定性较差，形成螺旋的长度没有显著的倾　向性；在长度为０．５５～０．６０￣ｌＪ达峰值，也仅有３１．９％的　概率。在强碱性环境下，该区域形成长螺旋的几率　。　。　。　，。。．，　，　，　明显比中性环境时大，特别倾向于形成０．Ｌ７０～０．８０和　．　麟　　。　，　ｌ２Ｏ　～　１００　誊８ｏ　性　＂一　鼋６０　主４ｏ　２Ｏ　Ｏ　Ｏ　５　１０　瓣　ｄ吐　ｌ５　ｒ薹２Ｏ　　２５　３０　３５　Ｒｅｓｉｄｕｅ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　一～　ａ　１　窒　磊　童　山　Ｏ　５　１０　ｌ５　２０　２５　３０　３５　Ｒｅｓｉｄｕｅ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｂ　ａ：中性条件下形成二级结构情况；　ｂ：强碱性条件下形成二级结构情况　图１不同模拟环境下抗菌肽ＬＬ一３７残基形成不同　二级结构的概率　Ｆｉｇ．１　Ｔｈｅ　ｐｏｓｓｉｂｌｅ　ｓｅｃｏｎｄａｒｙ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｆｏｒｍａｔｉｏｎ　ｏｆ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ－３７　ｒｅｓｉｄｕｅｓ　ｕｎｄｅｒ　ｔｗｏ　ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ　ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎ　ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ　２５０　基于分子动力学模拟研究ｐＨ对抗菌肽ＬＬ－３７结构的影响　彭冉等　２０１３，４１（２）：１４３—１４８．　拟结果表明，ＬＬ一３７螺旋形成和与膜结合是协同的，　溶液中存在的部分螺旋结构，可降Ｉ＇￣ＬＬ．３７与膜结合　时构象转换的能量壁垒。　本文首次利用分子动力学模拟技术研究了抗菌　［９］　Ｒｉｃｏ—Ｍａｔａ　Ｒ，Ｄｅ　Ｌｅｏｎ—Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ　Ｌ　Ｍ，Ａｖｉｌａ　Ｅ　Ｅ．Ｅｆｆｅｃｔ　ｏｆ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅｓ　ｄｅｒｉｖｅｄ　ｆｒｏｍ　ｈｕｍａｎ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ　ＬＬ一　３７　ｏｉｌ　Ｅｎｔａｍｏｅｂａ　ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃａ　ｔｒｏｐｈｏｚｏｉｔｅｓ［Ｊ］．Ｅｘｐ　Ｐａｒａｓｉｔｏｌ，　肽ＬＬ一３７在不同ｐＨ溶液下的结构特征，这对进一步　了解其抗菌机制及新药物设计，具有重要帮助。同　时，ＬＬ一３７属于固有无序蛋白，是一类柔性很大、缺　乏稳定三维结构的一类蛋白质，其构象集合的变化　可能不同于球状结构蛋白质。在ｐＨ的影ＤＲＴ，ＬＬ．３７　构象集合变化也可能具有固有无序蛋白质的独特特　征，这些特征或许与其抗菌功能存在着某种联系，　但是这需要对ＬＬ一３７开展大规模独立模拟才可能进行　量化分析，是一个值得研究的问题。　参考文献　Ｗａｎｇ　Ｇ．Ｄａｔａｂａｓｅ—ｇｕｉｄｅｄ　ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ　ｏｆ　ｐｏｔｅｎｔ　ｐｅｐｔｉｄｅｓ　ｔｏ　ｃｏｍｂａｔ　ＨＩＶ－１　ｏｒ　ｓｕｐｅｒｂｕｇｓ［Ｊ］．Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ（ＢａｓｅＯ，　２０１３，６（６）：７２８—７５８．　【２　２］Ｎｏｏｒｅ　Ｊ，Ｎｏｏｒｅ　Ａ，Ｌｉ　Ｂ．Ｃａｔｉｏｎｉｃ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７　ｉｓ　ｅｆｆｅｃｔｉｖｅ　ａｇａｉｎｓｔ　ｂｏｔｈ　ｅｘｔｒａ—ａｎｄ　ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ　Ｓｔａｐｈ３　ｌｏｃｏｃｃｕｓ　ａｕｒｅｕｓ［Ｊ］．Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ　Ａｇｅｎ￣Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ，　２０１３，５７（３）：１２８３—１２９０．　［３】　刘娃，纪森林，宋玉竹．细菌对抗菌肽的耐受机制［Ｊ］．生命　科学，２０１３，２５（１Ｏ）：１００８—１０１４．　［４］　Ｖａｎｄａｍｍｅ　Ｄ，Ｌａｎｄｕｙｔ　Ｂ，Ｌｕｙｔｅｎ　ｅｔ　ａ１．Ａ　ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ　ｓｕｍｍａｒｙ　ｏｆＬＬ－３７，ｔｈｅ　ｆａｃｔｏｔｕｍ　ｈｕｍａｎ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ　ｐｅｐｔｉｄｅ［Ｊ］．　Ｃｅｌｌ　Ｉｍｍｕｎｏｌ，２０１２，２８ｏ（１）：２２—３５．　【５］　Ｔｒｉｐａｔｈｉ　Ｓ，Ｔｅｃｌｅ　Ｌ　ＶｅｒｍａＡ，ｅｔ　ａ１．Ｔｈｅ　ｈｕｍａｎ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ　ＬＬ－３７　ｉｎｈｉｂｉｔｓ　ｉｎｆｌｕｅｎｚａ　Ａ　ｖｉｒｕｓｅｓ　ｔｈｒｏｕｇｈ　ａ　ｍｅｃｈａｎｉｓｍ　ｄｉｓｔｉｎｃｔ　ｆｒｏｍ　ｔｈａｔ　ｏｆ　ｓｕｒｆａｃｔａｎｔ　ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｄ　ｏｒ　ｄｅｆｅｎｓｉｎｓ［Ｊ］．Ｊ　Ｇｅｎ阳　，，２０１　３，９４（Ｐｔ　１）：４０—４９．　［６］　Ｓｉｎｇｈ　Ｄ，Ｑｉ　Ｒ，Ｊｏｒｄａｎ　Ｊ　Ｌ，ｅｔ　ａ１．Ｔｈｅ　ｈｕｍａｎ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７，ｂｕｔ　ｎｏｔ　ｔｈｅ　ｍｏｕｓｅ　ｏｒｔｈｏｌｏｇ，ｍＣＲＡＭＰ，ｃａｎ　ｓｔｉｍｕｌａｔｅ　ｓｉｇｎａｌｉｎｇ　ｂｙ　ｐｏｌｙ（Ｉ：Ｃ）ｔｈｒｏｕｇｈ　ａ　ＦＰＲＬ１一ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ｐａｔｈｗａｙ［Ｊ］．ＪＢｉｏｌ　Ｃｈｅｍ，２０１３，２８８（１２）：８２５８—８２６８．　【７］　Ｓａｌｖａｄｏ　Ｍ　Ｄ，Ｄｉ　Ｇｅｎｎａｒｏ　Ａ，Ｌｉｎｄｂｏｍ　Ｌ，ｅｔ　ａ１．Ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ　ＬＬ－—３　７　ｉｎｄｕｃｅｓ　ａｎｇｉｏｇｅｎｅｓｉｓ　ｖｉａ　ＰＧＥ２・－ＥＰ３　ｓｉｇｎａｌｉｎｇ　ｉｎ　ｅｎｄｏｔｈｅｌｉａｌ　ｃｅｌｌｓ，ｉｎ　ｖｉｖｏ　ｉｎｈｉｂｉｔｉｏｎ　ｂｙ　Ａｓｐｉｒｉｎ［Ｊ］．　Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ　Ｔｈｒｏｍｂ　Ｖａｓｃ　Ｂｉｏｌ，２０１３，３３（８）：１９６５—１９７２．　［８］　Ｒｉｖａｓ—Ｓａｎｔｉａｇｏ　Ｂ，Ｒｉｖａｓ　Ｓａｎｔｉａｇｏ　Ｃ　Ｅ，Ｃａｓｔａｎｅｄａ—Ｄｅｌｇａｄｏ　Ｊ　Ｅ，ｅｔ　ａ１．Ａｃｔｉｖｉｔｙ　ｏｆ　ＬＬ一３７，ＣＲＡＭＰ　ａｎｄ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ—ｄｅｒｉｖｅｄ　ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ　Ｅ２，Ｅ６　ａｎｄ　ＣＰ２６　ａｇａｉｎｓｔ　Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ［Ｊ］．１ｎｔ　Ｊ　Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ　Ａｇｅｎｔｓ，　２０１３，１３３（３）：３００－３０６．　［１０】　Ｐｉｎｈｅｉｒｏ　ｄａ　Ｓｉｌｖａ　Ｆ，Ｍｅｄｅｉｒｏｓ　Ｍ　Ｃ，Ｓａｎｔｏｓ　Ａ　Ｂ，ｅｔ　ａ１．Ｎｅｕｔｒｏｐｈｉｌｓ　ＬＬ一３　７　ｍｉｇｒａｔｅ　ｔｏ　ｔｈｅ　ｎｕｃｌｅｕｓ　ｄｕｒｉｎｇ　ｏｖｅｒｗｈｅｌｍｉｎｇ　ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ［Ｊ］．Ｔｉｓｓｕｅ　Ｃｅ１１，２０１３，４５（５）：３１８—３２０．　Ｚａｓｌｏｆｆ　Ｍ．Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅｓ　ｏｆ　ｍｕｌｔｉｃｅｌｌｕｌａｒ　ｏｒｇａｎｉｓｍｓ［Ｊ］．Ｎａｔｕｒｅ，２００２，４１５（６８７０）：３８９—３９５．　［１２］　Ｓｉｃｋｍｅｉｅｒ　Ｍ，Ｈａｍｉｌｔｏｎ　Ｊ　Ａ，ＬｅＧａｌｌ　Ｔ，ｅｔ　ａ１．ＤｉｓＰｒｏｔ：ｔｈｅ　ｄａｔａｂａｓｅ　ｏｆ　ｄｉｓｏｒｄｅｒｅｄ　ｐｒｏｔｅｉｎｓ［Ｊ］．Ｎｕｃｌｅｉｃ　Ａｃｉｄｓ　Ｒｅｓ，２００７，　３５（ｓｕｐｐｌ　ｌ１：Ｄ７８６—７９３．　［１３】　Ｐｏｒｃｅｌｌｉ　Ｆ！Ｖｅｒａｒｄｉ　Ｒ，Ｓｈｉ　Ｌ，ｅｔ　ａ１．ＮＭＲ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ—ｄｅｒｉｖｅｄ　ｈｕｍａｎ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７　ｉｎ　ｄｏｄｅｃｙｌｐｈｏｓｐｈｏｃｈｏｌｉｎｅ　ｍｉｃｅｌｌｅｓ［Ｊ］．Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００８，　４７（２０）：５５６５—５５７２．　［１４］　Ｗａｎｇ　Ｇ．Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ　ｏｆ　ｈｕｍａｎ　ｈｏｓｔ　ｄｅｆｅｎｓｅ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎ　ＬＬ・　３７　ａｎｄ　ｉｔｓ　ｓｍａｌｌｅｓｔ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＫＲ一１　２　ｉｎ　ｌｉｐｉｄ　ｍｉｃｅｌｌｅｓ［Ｊ］．ＪＢｉｏｌ　Ｃｈｅｍ，２００８，２８３（４７）：３２６３７—３２６４３．　［１５］　Ｊｏｈａｎｓｓｏｎ　Ｊ，Ｇｕｄｍｕｎｄｓｓｏｎ　Ｇ　Ｈ，Ｒｏｔｔｅｎｂｅｒｇ　Ｍ　Ｅ，ｅｔ　ａ１．Ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ—ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ａｎｔｉｂａｃｔｅｒｉａｌ　ａｃｔｉｖｉｔｙ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｎａｔｕｒａｌｌｙ　ｏｃｃｕｒｒｉｎｇ　ｈｕｍａｎ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７［Ｊ］．Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ，　１９９８，２７３（６）：３７１８—３７２４．　［１６］　Ｖａｎ　Ｄｅｒ　Ｓｐｏｅｌ　Ｄ，Ｌｉｎｄａｈｌ　Ｅ，Ｈｅｓｓ　Ｂ，ｅｔ　ａ１．ＧＲＯＭＡＣＳ：　ｆａｓｔ，ｆｌｅｘｉｂｌｅ，ａｎｄ　ｆｒｅｅ［Ｊ］．Ｊ　Ｃｏｍｐｕｔ　Ｃｈｅｍ，２００５，２６（１６）：　１７０１．１７１８．　【１７］　Ｊｏｒｇｅｎｓｅｎ　Ｗ　Ｌ，Ｍａｘｗｅｌｌ　Ｄ　Ｓ，Ｔｉｒａｄｏ　Ｒｉｖｅｓ　Ｊ．Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ　ａｎｄ　ｔｅｓｔｉｎｇ　ｏｆｔｈｅ　ＯＰＬＳ　ａｌｌ—ａｔｏｍ　ｆｏｒｃｅ　ｉｆｅｌｄ　ｏｎ　ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌ　ｅｎｅｒｇｅｔｉｃｓ　ａｎｄ　ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ　ｏｆ　ｏｒｇａｎｉｃ　ｌｉｑｕｉｄｓ［Ｊ］．ＪＡｍ　Ｃｈｅｍ　Ｓｏｃ，１９９６，１１８（４５）：１１２２５一ｌ１２３６．　［１８］　Ｚｉｅｌｋｉｅｗｉｃｚ　Ｊ．Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ　ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ　ｏｆ　ｗａｔｅｒ：ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　ＳＰＣ，ＳＰＣＥ，ＴＩＰ４Ｐ，ａｎｄ　ＴＩＰ５Ｐ　ｍｏｄｅｌｓ　ｏｆ　ｗａｔｅｒ［Ｊ］．Ｊ　（ｈｅｍ　ＰｈｙＳ，２００５，１２３（１０）：１０４５０１．　【１９］　ＢｕｓｓｉＧ，ＤｏｎａｄｉｏＤ，ＰａｒｆｉｎｅｌｌｏＭ．Ｃａｎｏｎｉｃａｌ　ｓａｍｐｌｉｎｇｔｈｒｏｕｇｈ　ｖｅｌｏｃｉｔｙ　ｒｅｓｃａｌｎｉｇ［Ｊ］．ＪＣｈｅｍ　Ｐｈｙｓ，２００７，１２６（１）：０１４１０１．　［２Ｏ】　Ｂｅｒｅｎｄｓｅｎ　Ｈ　Ｊ，Ｐｏｓｔｍａ　Ｊ　Ｐ　Ｍ，ｖａｎ　Ｇｕｎｓｔｅｒｅｎ　Ｗ　Ｆ，ｅｔ　ａ１．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｄｙｎａｍｉｃｓ　ｗｉｔｈ　ｃｏｕｐｌｉｎｇ　ｔｏ　ａｎ　ｅｘｔｅｒｎａｌ　ｂａｔｈ［Ｊ］．　Ｊ　Ｃｈｅｍ　Ｐｈｙｓ，１９８４　８１（８）：３６８４－３６９０．　［２１】　Ｒｙｃｋａｅｒｔ　Ｊ　Ｐ，Ｃｉｃｃｏｔｔｉ　Ｇ，Ｂｅｒｅｎｄｓｅｎ　Ｈ　Ｊ．Ｎｕｍｅｒｉｃａｌ　ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｃａｒｔｅｓｉａｎ　ｅｑｕａｔｉｏｎｓ　ｏｆ　ｍｏｔｉｏｎ　ｏｆ　ａ　ｓｙｓｔｅｍ　ｗｉｔｈ　ｃｏｎｓｔｒａｉｎｔｓ：ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｄｙｎａｍｉｃｓ　ｏｆ　ｎ—ａｌｋａｎｅｓ［Ｊ］．Ｊ　（下转第２７７页）　瑞安地区肺炎克雷伯菌ＥＳＢＬｓ）￣ＡｍｐＣ　３－内酰胺酶的基因分布与耐药特性的相关性研究涂斐佩等　２７７　合表２可以看出，我院临床上大部分为多重耐药的肺　参考文献　吴爱武，郑贵星，江锋利，等．铜绿假单胞菌ＥＳＢＬ和ＡｍｐＣ　酶表型检出与耐药性分析［Ｊ］．中国卫生检验杂志，２００６，　１６（１）：８８—８９．　［２］　娄美萍，林平．社区与医院感染中肺炎克雷伯菌和大肠埃希　炎克雷伯菌感染，即ＥＳＢＬｓ阳性，占７２％，少部分为　ＡｍｐＣ　ｐ一内酰胺酶阳性。ＥＳＢＬｓ￣Ｈ性组中多药耐药菌　株对３类（比如氨基糖苷类、红霉素、ｐ．内酰胺类）或　３类以上抗菌药物同时耐药ｅ￣８８％（３１７株），明显高于　阴性组的９．０％（１３株），给临床抗感染治疗带来极大　的威胁。其中，ＥＳＢＬｓ包括ＥＭ、ＳＨＶ、ＶＥＢ、ＰＥＲ、　ＧＥＳ、ＴＬＡ、ＩＢＣ、ＣＴＸ．Ｍ—ｌ、ＣＴＸ．Ｍ．２、ＣＴＸ—Ｍ．８、　菌耐药性分析［　中国微生态学杂志，２０１２，２４（２）：１６７．１６９．　Ｊ］．　［３］　钟海琴，蔡挺．肺炎克雷伯菌多药耐药机制研究进展［国际检验医学杂志，２０１２，３３（６１：７３５．７３７．　【４］　Ｗｅｂｓｔｅｒ　Ｄ　Ｐ，Ｇａｕｌｔｏｎ　Ｔ，Ｗｏｏｄｆｏｒｄ　Ｎ．Ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ　ｏｆ　ｃａｒｂａｐｅｎｅｍ　ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ　ｄｕｅ　ｔｏ　ｐｏｒｉｎ　ｌｏｓｓ　ｉｎ　ａｎ　ｅｘｔｅｎｄｅｄ－　ＣＴＸ－Ｍ．９、ＯＸＡＩ、ＯＸＡＩＩ、ＯＸＡⅡＩ、ＯＸＡＩＶ￣ｆＤＯＸＡＶ　等，ＡｍｐＣ［｝－内酰胺酶基因ＣＩＴ、ＭＯＸ、ＤＨＡ、ＡＣＣ、　ＥＢＣ和Ｆ０Ｘ等［５］。虽然两种者基因型分布种类较多，　但我们发现，流行于我们医院的肺炎克雷伯菌主要为　ＥＳＢＬｓ基因阳性，大部分为ＳＨＶ型。这与Ｓｏｌｅｘａ￣，］１序法　研究肺炎克雷伯菌质粒基因组的耐药基因中的预测一　ｓｐｅｃｔｒｕｍ—ｌａｃｔａｍａｓｅ（ＥＳＢＬ、一ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ　ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ　ｓｔｒａｉｎ　ｄｕｒｉｎｇ　ｍｅｒｏｐｅｎｅｍ　ｔｈｅｒａｐｙ［Ｊ］．／ｎｔ／　Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ　Ａｇｅｎｔｓ，２０１０，３６（６）：５７５—５７６．　－２００８年江汉平原地区产超　［５］　陈铭，艾彪，杨德春，等．２０００－致［　。也与我们前期检测结果一致【　】。由于本地区肺　炎克雷伯菌为主要的医院感染菌株，基于基因分布情　况，为该菌株的经验治疗提供了重要的依据。再下一　广谱ｐ．内酰胺酶肠杆菌科流行率及耐药性变迁［Ｊ］．中华　医院感染学杂志，２０１０，２０（１３１：１９２１—１９２３．　ｅｘａ￣，Ｏ序法研宄肺炎克雷　［６］　李劲松，高升杰，周铁丽，等．Ｓｏｌ伯菌质粒基因组的耐药基因【Ｊ］．中华微生物学与免疫学　杂志，２００９，２９（１２）：１　１４０—１　１４３．　［７］　张新明，陈连平，涂斐佩．肺炎克雷伯菌ＥＳＢＬｓ及ＡｍｐＣ　阶段的实验研究中，为了解肺炎克雷伯菌耐药情况的　基因多态性提供充足的实验依据。我们通过脉冲场凝　胶电泳分析不同菌株问是否存在同源性，对本地区肺　炎克雷伯菌的流行特点提供有力的证据，以加强肺炎　克雷伯菌的预防。　ｂｅｔａ．内酰胺酶的基因分布与耐药特性的相关性研究［Ｊ］．　中国微生态学杂志，２０１４，２６（９）：１０８４．１０８７．　（上接第２５０页）　Ｃｏｍｐｕｔ　Ｐ矗　，１９７７，２３（３）：３２７－３４１．　［２２］Ｈｅｉｎｉｇ　Ｍ，Ｆｒｉｓｈｍａｎ　Ｄ．ＳＴＲＩＤＥ：ａ　ｗｅｂ　ｓｅｒｖｅｒ　ｆｏｒ　ｓｅｃｏｎｄａｒｙ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ａｓｓｉｇｎｍｅｎｔ　ｆｒｏｍ　ｋｎｏｗｎ　ａｔｏｍｉｃ　ｃｏｏｒｄｉｎａｔｅｓ　ｏｆ　ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｈｕｍａｎ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＬＬ一３７　ｉｎ　ｐｈｏｓｐｈｏｌｉｐｉｄ　ｍｅｍｂｒａｎｅｓ：ｒｅｌｅｖａｎｃｅ　ｔｏ　ｔｈｅ　ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　ｂａｓｉｓ　ｆｏｒ　ｉｔｓ　ｎｏｎ—ｃｅｌｌ—ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ　ａｃｔｉｖｉｔｙ［Ｊ］．Ｂｉｏｃｈｅｍ　１　９９９，３４１（　Ｐｔ　３１：５０１－５１３．　ｐｒｏｔｅｉｎｓ［Ｊ］．ＮｕｃｌｅｉｃＡｃｉｄｓ　Ｒｅｓ，２００４，３２（ｓｕｐｐｌ　２）：Ｗ５００－５０２．　ｆ２３１　Ｗａｎｇ　Ｇ，Ｗａｔｓｏｎ　Ｋ　Ｍ，Ｂｕｃｋｈｅｉｔ　Ｒ　Ｊｒ．Ａｎｔｉ—ｈｕｍａｎ　［２６１　Ｇｌａｓｅｒ　Ｒ　Ｗ．Ｓａｃｈｓｅ　Ｃ，Ｄｕｒｒ　Ｕ　Ｈ，ｅｔ　ａ１．Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎ－　ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ　ｒｅａｌｉｇｎｍｅｎｔ　ｏｆ　ｔｈｅ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ＰＧＬａ　ｉｍｍｕｎｏｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ　ｖｉｒｕｓ　ｔｙｐｅ　１　ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ　ｏｆ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅｓ　ｄｅｒｉｖｅｄ　ｆｒｏｍ　ｈｕｍａｎ　ａｎｄ　ｂｏｖｉｎｅ　ｃａｔｈｅｌｉｃｉｄｉｎｓ［Ｊ］＿　Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ　Ａｇｅｎｔｓ　Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ，２００８，５２（９）：３４３８—３４４０．　『２４１　Ｌｉ　Ｘ，Ｌｉ　Ｈａｎ　Ｈ，ｅｔ　ａ１．Ｓｏｌｕｔｉｏｎ　ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ　ｏｆ　ｈｕｍａｎ　ＬＬ－　３７　ｆｒａｇｍｅｎｔｓ　ａｎｄ　ＮＭＲ・ｂａｓｅｄ　ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ　ｏｆ　ａ　ｍｉｎｉｍａｌ　ｉｎ　ｌｉｐｉｄ　ｍｅｍｂｒａｎｅｓ　ｏｂｓｅｒｖｅｄ　ｂｙ　ｓｏｌｉｄ－ｓｔａｔｅ　１　９Ｆ—ＮＭＲ［Ｊ］．　Ｂｉｏｐｈｙｓ　２００５，８８（５）：３３９２—３３９７．　［２７］Ｚｈａｏ　Ｃ，Ｎｇｕｙｅｎ　Ｔ，Ｂｏｏ　Ｌ　Ｍ，ｅｔ　ａ１．ＲＬ－３７，ａｎ　ａｌｐｈａ・ｈｅｌｉｃａｌ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ｐｅｐｔｉｄｅ　ｏｆ　ｔｈｅ　ｒｈｅｓｕｓ　ｍｏｎｋｅｙ［Ｊ］．Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ　Ａｇｅｎｔｓ　Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ，２００１，４５（１Ｏ）：２６９５—２７０２．　ｍｅｍｂｒａｎｅ—ｔａｒｇｅｔｉｎｇ　ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌ　ａｎｄ　ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ［Ｊ］．　ＪＡｍ　Ｃｈｅｍ　Ｓｏｃ，２００６，１２８（１７）：５７７６—５７８５．　［２５】Ｏｒｅｎ　Ｚ，Ｌｅｒｍａｎ　Ｊ　Ｃ，Ｇｕｄｍｕｎｄｓｓｏｎ　Ｇ　Ｈ，ｅｔ　ａ１．Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ　ａｎｄ　［２８１赵立岭，王吉华，窦相华，等．蛋白质折叠速度与其拓扑结　构关系的研究［Ｊ］．生物数学学报，２００５，２０（３）：３３２．３３８．