单位六天工作制是合法的，只要用人单位的总工作时间没有超过规章的之间即可。不定时工作制，即经劳动保障部门审批，甲方在保障工人身体健康并充足听取工人意见的基础上，应采用集中工作、集中休息、轮休调休、弹性工作时间等适当方法，确保工人的休息休假权利和生产、工作任务的完成。相关法律没有说不能安排员工上六天班。只说实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。工作时间又称劳动时间。是指法律规章的劳动者在一昼夜和一周内从事劳动的时间。工作时间的长度由法律直接规章，或由集体合同或劳动合同直接规章。劳动者或用人单位不遵守工作时间的规章或约定，要承担相应的法律责任。
合法不合法，除了看劳动部门审批，还要看看他薪资如何发的，是否给了足额加班费。劳动法规章每周至少休息一天，所以一周六天工作制加班是合法的，周六上班不算是加班，因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
法律依据：《国务院关于职工工作时间的规章》
第三条职工每日工作8小时、每周工作40小时。
第五条因工作性质或者生产特点的限制，不能实行每日工作8小时、每周工作40小时标准工时制度的，按照国家有关规章，可以实行其他工作和休息办法。
第六条任何单位和个人不得擅自延长职工工作时间。因特殊情况和紧急任务确需延长工作时间的，按照国家有关规章执行。
《中华人民共和国劳动法》
第三十六条国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
第三十八条用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
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