商品房公寓过户费计算方式如下：
1、契税：一般是房款的1%，面积在90平米以下并且是首套房的可以缴纳1%，面积在90平以上144平以下缴纳1.5%，面积在144平米以上的需要缴纳4%，以下情况按照3%缴纳：
（1）144平方以上；
（2）买方不是首次购房；
（3）车库；
（4）非普通住宅。
2、营业税：房产证未满5年的交5.6%，产证满五年可以免交营业税；
3、个人所得税，1%房产证满5年并且是唯一住房的可以免除；
4、交易费：3元每平方米；
5、测绘费：按各区具体规定；
6、工本费：一个证件80元，二个证件90；
7、评估费：评估总额的千分之五银行贷款需要缴纳。抵押工本费为100元银行贷款需要缴纳；
8、购房证明：20元一份一般需开3份；
9、公证收费标准：300元如不能本人亲自办理，需要办理本业务收费。
法律依据：《中华人民共和国城市房地产管理法》第六十条
房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。
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