储存条件
该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存可置于 2-8℃。2-8℃保存条件下,若溶液产生沉淀,使用前应将试剂盒内的溶液在室温放置一段时 间,必要时可在37℃水浴中预热10 min,以溶解沉淀。
注意事项 1.第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇。
2.样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量也下降。 3.若缓冲液GA或GB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。 4.所有离心步骤均为使用台式离心机,室温下离心。 操作步骤
使用前请先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。 1. 处理材料
用干烤过的镊子和剪刀剪取一定量的冰冻组织,体积约两个绿豆大小,放入
DNAase-free的1.5ml EP中。向EP管中加入等体积的磁珠,以及加入200 μl缓冲液GA,振荡悬浮。置于组织破碎仪中运行5mins/次,共3次。每破碎一次,需将含组织的EP管放入离心机中短暂离心来沉淀组织和磁珠,使其在下次破碎时更好的接触。可根据观察匀浆的效果来决定匀浆的次数,目标是“碾磨均匀”,不能有较大体积的组织块(>2mm的组织块)。
如果需要去除RNA,需加入4 μl RNaseA(100 mg/ml)溶液(客户自备,目录号:RT405-12),振荡15 sec,室温放置5 min。
2. 加入20 μl Proteinase K溶液,混匀。提取组织基因组时,加入Proteinase K混匀后,在56℃放置1~3 h,直至组织溶解,每小时颠倒混合样品2-3次,用水浴振荡器也可。放入10,000rpm (~11,500×g) 的离心力高速离心1mins来沉淀未碾碎的组织和磁珠。将上清转移至新的EP管中。
3. 加入200 μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10 min,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的水珠。注意:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA不纯。
4. 加人200 μl 无水乙醇,充分振荡混匀15 sec,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
5. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中), 12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
6. 向吸附柱CB3中加入500 μl缓冲液GD (使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
7. 向吸附柱CB3中加入600 μl 漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇), 12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。 8. 重复操作步骤7。
9. 将吸附柱CB3放回收集管中,12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min,倒掉废液。将吸附柱 CB3置于室温放置5mins,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
10. 将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200 μ(100ul)洗脱缓冲液TE,室温放置2-5 min,12,000 rpm (~13,400×g)离心 2 min,将溶液收集到离心管中。为增加基因组DNA 的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室温放置2 min,12,000 rpm (~13,400×g )离心2 min。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于50 μl,体积过小影响回收效率。洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于 7.0会降低洗脱效率;且DNA产物应保存在-20℃,以防DNA降解。
11. 溶解的DNA样品其 A260/280 比值< 1.7 ~ 1.9。将DNA溶液放入-20°C冰箱
中保存。
若要长期保存DNA样本,最好加入相应2.5倍体积的无水乙醇来沉淀DNA。混匀后便可看见白色絮状物。短暂离心后放置于-80℃低温冰箱中保存至少一年。
若需使用,需在7000~8000×g的离心机中离心5min,使DNA重新沉淀,再加入TE溶液溶解DNA沉淀。必要时须重新检测DNA的纯度和浓度。
DNA/RNA纯品的OD260/OD280为1.8或2.0,故根据OD260/OD280的值可以估计DNA的纯度。若比值较高说明含有RNA,比值较低说明有残余蛋白质存在。OD230/OD260的比值应在0.4-0.5之间,若比值较高说明有残余的盐存在。
DNA: OD260/OD280比值应接近1.80,若R值大于1.8。说明存在RNA,可重新用RNaseA处理。若R值小于1.8,则说明有蛋白质等杂质存在,需再用蛋白酶K、SDS及盼、氯仿、异戊醇重新对DNA进行纯化(也可加入1/8体积的3M NaAc(pH5.2)与冷乙醇一同促使DNA沉淀析出。
RNA: OD260/OD280比值在1.8-2.0时,认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓冲液检测吸光度时,R值可能会大于2(一般应该是<2.2的)。当R<1.8时,溶液中蛋白或者时其他有机物的污染比较明显,你可以根据自己的需要决定这份RNA的命运。当R>2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。
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