3年。绿色食品标志是由绿色食品发展中心在国家工商行政管理总局 商标 局正式注册的质量证明标志，其商标专用权受《中华人民共和国 商标法 》保护。通过绿色食品认证的产品可以使用统一格式的绿色食品标志，有效期为3年，时间从通过认证获得证书当日算起，期满后，生产企业必须重新提出认证申请，获得通过才可以继续使用该标志，同时更改标志上的编号。从重新申请到获得认证为半年，这半年中，允许生产企业继续使用绿色食品标志。如果重新申请没能通过认证，企业必须立即停止使用标志。另外，在3年有效期内，中国绿色食品发展中心每年还要对产品按照绿色食品的环境、生产及质量标准进行检查，如不符合规定，中心会取消该产品使用标志。
一、申请认证企业向市、县(市、区)绿色食品办公室(以下简称绿办)，或向省绿色食品办公室索取并下载《绿色食品申请表》。绿色食品认证程序二、市、县(市、区)绿办指导企业做好申请认证的前期准备工作，并对申请认证企业进行现场考察和指导，明确申请认证程序及材料编制要求，并写出考察报告报省绿办。省绿办酌情派员参加。三、企业按照要求准备申请材料，根据《绿色食品现场检查项目及评估报告》自查、草填，并整改，完善申请认证材料;市、县(市、区)绿办对材料审核，并签署意见后报省绿办。四、省绿办收到市、县(市、区)的考察报告、审核表及企业申请材料后，审核定稿。企业完成5套申请认证材料(企业自留1套复印件，报市、县绿办各1套复印件，省绿办1套复印件，中国绿色食品发展中心1套原件)和文字材料软盘，报省绿办。五、省绿办收到申请材料后，登记、编号，在5个工作日内完成审核，下发《文审意见通知单》(附件6)同时抄传中心认证处，说明需补报的材料，明确现场检查和环境质量现状调查计划。企业在10个工作日内提交补充材料。六、现场检查计划经企业确认后，省绿办派2名或2名以上检查员在5个工作日内完成现场检查和环境质量现状调查，并在完成后5个工作日内向省绿办提交《绿色食品现场检查项目及评估报告》、《绿色食品环境质量现状调查报告》。七、检查员在现场检查过程中同时进行产品抽检和环境监测安排，产品检测报告、环境质量监测和评价报告由产品检测和环境监测单位直接寄送中国绿色食品发展中心同时抄送省绿办。对能提供由定点监测机构出具的一年内有效的产品检测报告的企业，免做产品认证检测;对能提供有效环境质量证明的申请单位，可免做或部分免做环境监测。八、省绿办将企业申请认证材料(含《绿色食品标志使用申请书》、《企业及生产情况调查表》及有关材料)、《绿色食品现场检查项目及评估报告》、《绿色食品环境质量现状调查报告》、《省绿办绿色食品认证情况表》报送中心认证处;申请认证企业将《申请绿色食品认证基本情况调查表》报送中心认证处。九、中心对申请认证材料做出：“合格”、“材料不完整或需补充说明”、“有疑问，需现场检查”、“不合格”的审核结论，书面通知申请人，同时抄传省绿办。省绿办根据中心要求指导企业对申请认证材料进行补充。十、对认证终审结论为“认证合格”的申请企业，中心书面通知申请认证企业在60个工作日内与中心签定《绿色食品标志商标使用许可合同》，同时抄传省绿办。十一、申请认证企业领取绿色食品证书。