违反保密协议可能承担民事、行政和刑事责任。民事责任包括违约和侵权责任，用人单位可要求违约金或赔偿损失。行政责任根据《反不正当竞争法》规定，侵犯商业秘密者需支付赔偿和合理开支。刑事责任根据《刑法》规定，造成重大损失者可被判处有期徒刑和罚金。
法律分析
1、民事责任：违反保密协议首先要承担的是民事责任
民事责任又可以分为违约责任和侵权责任。雇员违反保密协议很可能同时侵犯了用人单位的商业秘密，给用人单位造成了实际损失。因此，用人单位可以要求雇员承担违反保密协议约定的违约责任，如果保密协议中约定了违约金，则用人单位可以要求违约的雇员支付违约金。如果违约金畸高或者畸低，双方可以要求适当降低或提高。用人单位也可以选择要求雇员承担赔偿损失的侵权责任。但违约责任与侵权责任不能同时适用，用人单位只能从中选择一种。
2、行政责任：侵犯用人单位的商业秘密也可能构成行政责任
根据《反不正当竞争法》第17条的规定，经营者恶意实施侵犯商业秘密行为，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。赔偿数额还应当包括经营者为制止侵权行为所支付的合理开支。
经营者违反本法第六条、第九条规定，权利人因被侵权所受到的实际损失、侵权人因侵权所获得的利益难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予权利人五百万元以下的赔偿。
3、刑事责任：任侵犯用人单位的商业秘密还可能承担刑事责任
根据《刑法》的有关规定，如有以下行为，并且给商业秘密的权利人造成重大损失的，处3年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金，造成特别严重后果的，除3年以上7年以下有期徒刑，并处罚金。
结语
保护商业秘密至关重要，违反保密协议将承担民事责任。用人单位可要求违约雇员支付违约金或赔偿损失。同时，侵犯商业秘密行为也可能构成行政责任，根据《反不正当竞争法》规定，赔偿数额可高达数倍。此外，涉及重大损失的侵犯行为还可能承担刑事责任，刑法规定相应刑罚。综上所述，保护商业秘密是一项重要任务，违反保密协议将面临民事、行政和刑事责任的追究。
法律依据
中华人民共和国保守国家秘密法（2010修订）：第三章 保密制度 第三十五条 在涉密岗位工作的人员（以下简称涉密人员），按照涉密程度分为核心涉密人员、重要涉密人员和一般涉密人员，实行分类管理。
任用、聘用涉密人员应当按照有关规定进行审查。
涉密人员应当具有良好的政治素质和品行，具有胜任涉密岗位所要求的工作能力。
涉密人员的合法权益受法律保护。
中华人民共和国保守国家秘密法（2010修订）：第三章 保密制度 第三十八条 涉密人员离岗离职实行脱密期管理。涉密人员在脱密期内，应当按照规定履行保密义务，不得违反规定就业，不得以任何方式泄露国家秘密。
中华人民共和国保守国家秘密法（2010修订）：第五章 法律责任 第四十九条 机关、单位违反本法规定，发生重大泄密案件的，由有关机关、单位依法对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予处分；不适用处分的人员，由保密行政管理部门督促其主管部门予以处理。
机关、单位违反本法规定，对应当定密的事项不定密，或者对不应当定密的事项定密，造成严重后果的，由有关机关、单位依法对直接负责的主管人员和其他直接责任人员给予处分。