离婚时夫妻共同居住的公房应该按照以下方法处理：
1、双方所争议的房屋面积较大，可以隔断分开的，分别承租；
2、有条件的单位和个人，由房地产部门和单位另行解决；
3、参考当地出租房屋平均租金的标准对一方进行经济补偿。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。