新生儿生理性黄疸的检查包括血清胆红素、血清转氨酶、核素检查、肝活检等，其具体检查方法如下叙述。
1、血清胆红素：多次测定逐渐增高提示胆道闭锁，若有波动或不规则地下降提示肝炎。
2、血清转氨酶：早期明显增高是提示肝炎。
3、其他实验室检查：血清5′-核苷酸酶明显增高提示胆道闭锁。血清甲胎蛋白>40mg/L提示肝炎。十二指肠引流液含有胆汁或胆酸可排除外胆道闭锁，脂蛋白-X（LP-X）阳性者提示胆道闭锁。
4、静注131I玫瑰红37～148MBq（1～4μCi），收集3天粪便（不能混有尿液）测每分钟计数，如>10%的注入量即可排除胆道闭锁。
5、核素肝、胆扫：描静注99m锝标记的亚氨二醋酸（IDA）衍化物后扫描，肝炎患儿的肝脏显影缓慢而肠道出现放射性浓集，胆道闭锁患儿肝显影出现快，肠道不出现显影。
6、B超：可发现总胆道管囊肿，如无胆囊提示胆道闭锁。
7、肝活检：可见肝结构基本正常，胆小管大量增生提示胆道闭锁。肝小叶结构紊乱、肝细胞坏死、多核巨细胞易见到提示肝炎。
8、剖腹探查：争取在2个月内施行，如无胆囊宜进一步探查。如有胆囊，应进行胆囊造影；如异常则作肝门空肠吻合术（越早施行效果越好，最迟不超过3个月）。