其结晶的速度与其含有的葡萄糖结晶核、温度、水分蜜源有关。 蜂蜜中的葡萄糖结晶核非常细小，存在于花蜜中和贮存过蜂蜜旧巢脾中。在一定条件下，蜂蜜中的葡萄糖就围绕这些细小的晶核长大结晶。蜂蜜内含有结晶核越多，结晶的速度就越快。 蜂蜜结晶速度的快慢也受到温度的影响，在13——14℃时最容易结晶。若低于此温度，由于蜂蜜的粘稠度提高，致使蜂蜜结晶迟缓;若高于此温度，由于提高了糖的溶解度，从而减少了溶液的过饱和程度，也使结晶变慢。
因此在保存蜂蜜的过程中，就要控制好温度以延缓蜂蜜结晶的过程。 蜂蜜的结晶还与蜂蜜的种类、含水量有关。如紫云英蜜、刺槐蜜、枣花蜜则不易结晶;而油菜花蜜、野坝子蜜、棉花蜜、向日葵蜜就易于结晶。全部结晶的蜂蜜，一般含水量较低，宜长期保存不易变质。含水量多的未成熟蜂蜜由于溶液的过饱和程度降低，结晶速度也会变慢或不能全部结晶。
使结晶的葡萄糖沉到底部，其它稀薄的蜂蜜浮在上层，这种半结晶的蜂蜜其营养成分也未发生变化，只是未结晶蜂蜜含水量相应增加，因此这种蜂蜜不宜长期保存。 总之，蜂蜜结晶是蜂蜜的一种物理现象，其化学成分、营养价格都未发生变化，更不会影响蜂蜜的质量。结晶的晶体是葡萄糖，并非蜂蜜中掺入了白糖，其实真正掺入白糖的蜂蜜不易发生结晶现象，易于结晶的蜂蜜才是纯正的蜂蜜，结晶并不影响质量。 从蜂巢里分离出来的新鲜蜂蜜，大都是粘稠的透明或半透明的胶状液体。在一般条件下贮存，有的蜂蜜就会逐渐混浊，而后凝结成白色的晶体，这是蜂蜜的自然结晶。
蜂蜜的结晶是一种物理现象，一般情况下不影响其内在质量。解释蜂蜜的这种结晶现象，就必须了解影响结晶的有关因素及其原理过程。 影响蜂蜜结晶的因素很多，结晶的快慢与所含的葡萄糖结晶核的数量、温度高低、含水量和直接形成蜂蜜的化学组分的蜜源花种有着密切的关系。通常条件下，蜂蜜中葡萄糖的含量越高，结晶核的数量也越多，结晶的速度就越快。
1 蜂蜜结晶速度与温度的关系 蜂蜜在13~14℃时，最容易结晶，若低于此温度时，虽然葡萄糖的过饱和程度加大，但由于蜂蜜中果糖、麦芽糖、糊精和胶状体物质等在低温下的粘滞度和密度却大大提高，从而降低和阻碍结晶核的运动和扩散作用，结晶反而迟缓。
若高于此温度，蜂蜜的粘滞度虽然降低了，但是葡萄糖的溶解度却提高了，从而减少了溶液的过饱和程度，也使结晶变慢，甚至使结晶融化。
2 含水量与蜂蜜结晶的速度 不成熟的蜂蜜由于含水量高(一般超过26%)，过饱和程度低，结晶的速度变慢，有的不能全部结晶，由于蜂蜜的粘滞度小，结晶的葡萄糖沉到容器底部，其它稀薄的糖液浮在上层，成为液、固两相、即半结晶状态。
这种增结晶的蜂蜜中结晶的那部分葡萄糖只含9.1%的水分，其它未结晶部分的含水量就相应增高。同一花种的蜂蜜，其含水量低的结晶快，含水量高的结晶慢。甚至不结晶。
3 不同蜜源的蜂蜜，结晶的速度、程度和形态 一般葡萄糖、蔗糖和松三糖含量较高的蜂蜜，容易结晶，如油菜蜜、棉花蜜、葵花蜜、野坝子蜜、鸭脚木蜜以及一些甘露蜜等。而含果糖、麦芽糖、糊精和胶体物质较多的蜂蜜则不易结晶，甚至永远不会结晶。如纯度较高的刺槐蜜、枣花蜜、党参蜜等。
4蜂蜜结晶的形态 蜂蜜结晶的形态有油脂状、细粒状、粗粒状之分。若结晶核的数量多且密集，在形成结晶的过程中很快地全面展开，就形成了油脂状;若结晶核稍少，结晶又快，就形成细粒状;若结晶核的数量少，结晶又慢时，每个结晶核都有足够的葡萄糖分子使其成分起来，这样就能形成粗粒状或块状结晶。不同品种的蜂蜜结晶尽管有各种各样的形态，但都不会影响其内在质量，只是物理性状不同而已。 5 结晶的形成 引起和形成蜂蜜结晶的主要因素是蜂蜜中的葡萄糖、蔗糖、松三糖等，它们是以固体溶解后存在于蜂蜜中。蜂蜜又是由多种糖混合组成的过饱和溶液，当这些固体溶质的糖比量超过其它液态糖的一定比率，以及超过蜂蜜中所含水分的溶解度时，在一定的条件下(温度)，结晶即很快产生。
蜂蜜的结晶主要取决于葡萄糖和果糖之间的比量，也可以说是葡萄糖所占还原糖的百分比例。一般来说，当葡萄糖含量与果糖含量相等(1：1)，结晶缓慢;当比例为1：1.2时，一般不出现结晶;当比例为1：0.9时，结晶很快出现。 综上所述，蜂蜜的结晶，实质上是葡萄糖从蜂蜜中析出被分离的一种现象和过程。从分子论的观点来看，在蜂蜜里葡萄糖分子本来是毫无秩序地运动着的，但蜂蜜里葡萄糖超过它的溶解度，成为过饱和溶液时，就有一部分葡萄糖分子在蜂蜜里开始有规则地运动、排列起来，形成一个微小的结晶核，成为一个结晶的中心，更多的葡萄糖分子有规则地排列在它的各面，逐渐形成较大的晶体，从蜂蜜里分离出来，这就是蜂蜜结晶