头孢曲松钠作为菌素类的抗生素，对细菌感染有明显的预防作用。一些严重高危的疾病，或重度炎症，比如肺部、支气管、胸部、耳、鼻、喉等细菌感染的炎症，包括肾脏、血液、泌尿系统、、皮肤组织、骨骼肌肉组织等的感染都有极强预防作用。
头孢曲松钠对肠杆菌科细菌更有明显的作用。对其它的大肠、肺炎、产气等引起感染的细菌也有治疗作用。头孢曲松钠对阴沟肠杆菌的治疗效用比较差，但相比于流感、淋病和脑膜炎、溶血和肺炎引起的细菌感染更有直接干脆的疗效。
头孢曲松钠有极强的化学反应能力，一般不能与其它医疗要素随便的结合使用。比如，头孢曲松钠中混入霉素血管、去甲肾上腺素、醇类、维生素C等时，会使头孢曲松钠的性质发生变化，所处的药液会呈现污浊不透明的状态。所以在使用头孢曲松钠时，要掌握其化学变化的禁忌。
当患者在治疗前喝酒或进食酒精类的东西时，不能使用头孢曲松钠，否则会导致身体发生双硫仑样反应。这就要求患者要避免在使用头孢曲松钠前饮酒或进食酒精类的食物。
注射头孢曲松钠时应注意注射的位置，容易引起皮肤、血液、内脏等不良的身体反应。比如呕吐、腹泻、头昏、脑胀等现象。这要做好治疗后的修护工作，避免头孢曲松钠对身体的不良影响。
孕妇最需注意，在刚怀孕时容易对头孢曲松钠过敏。同时，患有黄疸的婴儿应避免使用头孢曲松钠。这对身体有不良影响。