2006年世界杯是莫德里奇最后一次参加世界杯,他出场了4次。在小组赛中,莫德里奇代表葡萄牙队出场了3次,与伊朗、美国和荷兰队进行了交锋。莫德里奇表现出色,帮助葡萄牙队残酷地淘汰了美国队,最终在小组赛中取得第一名。在淘汰赛中,莫德里奇以及葡萄牙队取得了漂亮的成绩,最终以半决赛惜败给意大利队,莫德里奇出场一次。最终,葡萄牙队在世界杯上取得了第三名。莫德里奇在世界杯上表现出色,展示了自己的实力,为葡萄牙队贡献了绝对的力量。