法律分析：在涉及到个人隐私的民事案件中，公司犯罪证据排除的适用需要考虑个人隐私权的保护。同时，排除证据的标准也依据于案件的具体情况而定。
法律依据：
1.《中华人民共和国民事诉讼法》第六十五条：当事人有证据推翻对方的主张，应当提交该证据。但是，法律规定不得使用的证据除外。
2.《中华人民共和国刑事诉讼法》第三百八十五条：不能作为证据的证据，不得在刑事诉讼中使用。不能作为证据的证据包括：
（一）非法获取的证据；
（二）因人身、财产安全等特殊情况而取得的证据，有重大瑕疵的；
（三）违反法律规定而取得的证据；
（四）其他不得作为证据的证据。
3.《中华人民共和国刑法》第二十八条：人民法院应当保护人民群众的合法权益，查明案件的事实，依法惩罚犯罪，排除非法证据，不得强迫被告人作无罪的证明。
综上所述，在个人隐私权保护的前提下，公司犯罪证据排除的适用需要依据具体案件情况而定。而在刑事案件中，违反法律规定而取得的证据将被排除。在民事案件中，不能作为证据的证据也将被排除。