公积金断交有下列影响:对已经存在公积金贷款者或者准备申请公积金贷款者存在影响,其他则无直接影响。如果员工已经申请公积金贷款,而且长期断交住房公积金的情况下,住房公积金管理中心可以根据合同约定,将剩余贷款按照商业贷款的利率来计算。