通常情况下，公司要合法解除严重违纪员工的劳动合同，可以按照以下方式进行操作：
1、公司规章制度已公示且被员工签收。
根据《劳动合同法》规定，用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
因此，凡是没有经过公示或告知劳动者的规章制度，就不具有规章制度应有的法律效力，所以公司在员工入职时，要保留员工签收公司规章制度的文件，这是辞退严重违纪员工的重要先决条件。
2、要开除严重违纪员工的，必须符合法定条件。
劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（1）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（2）严重违反用人单位的规章制度的；
（3）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（4）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（5）以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；
（6）被依法追究刑事责任的。
需要注意的是，公司在开除员工时，必须要有确实、充分的证据证明员工严重违纪或符合法定条件，否则不能开除员工。
3、公司应及时将解除合同的通知书交给员工，并理清结算工资等事宜。
根据《劳动合同法》规定，用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这样既能保护员工利益，又能降低发生纠纷的可能性。
用人单位违法解除劳动合同赔偿标准：按照经济补偿金标准的二倍向劳动者支付。根据劳动合同法的规定，用人单位违法解除劳动合同的，应当向劳动者支付二倍经济补偿金。
相关法律规定
《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。
员工严重违纪或严重失职单位解除劳动合同需提前30天通知吗
不需要。根据《劳动合同法》规定：员工存有严重违纪，或严重失职造成用人单位重大损害等过失性情形的，用人单位可以解除劳动合同。该解除行为是即时性的，无需提前30天。
由于该解除合同行为是由于员工的过错所导致，故用人单位无需向员工支付解除劳动合同的经济补偿金。
有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
(一)劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的;
(二)劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的;
(三)劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
相关法律规定
《劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
企业能否与在孕期严重违纪的女职工解除劳动合同
原则上用人单位不能因为女职工怀孕解除劳动合同，劳动合同应当延续到期哺乳期结束后方可终止合同。在员工没有过错的情况下，用人单位不能解除劳动合同，这是国家对特殊员工的特殊保护。只有两种情况下这些员工的劳动合同可以解除，第一个是员工本人提出，或者说跟员工本人协商一致。第二种情况下，员工本人存在严重违反劳动纪律，或者是违法犯罪的过错情况，除此之外，不得以任何理由解除怀孕女职工的劳动合同。
员工怎样能够解除员工的劳动合同
根据《劳动合同法实施条例》第十八条规定，员工解除劳动合同的方式如下：
1，员工必须提前30日以书面形式通知用人单位，在试用期内的提前3天通知用人单位。
劳动者提前以书面形式通知用人单位，既是解除劳动合同的程序，也是解除劳动合同的条件。
2，劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，解除劳动合同，无需征得用人单位的同意。
3，无论是劳动者还是用人单位在解除劳动合同时，都必须以书面形式告知对方。
公司解除劳动合同应该怎样赔偿员工？
单位解除劳动合同，主要分为三种。分别是合法解除、协商解除与违法解除，赔偿方式主要有不支付赔偿、支付经济补偿金和支付赔偿金。
(一)合法解除又分为不需要支付赔偿金和支付经济补偿金两种。依据《劳动合同法》第39条的规定，劳动者存在下列情形的，用人单位解除劳动合同，用人单位无须支付赔偿：
①在试用期间被证明不符合录用条件;
②严重违反用人单位的规章制度;
③严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损失;
④劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正;
⑤因欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同而致使劳动合同无效;
⑥被依法追究刑事责任。
员工违纪的处理时限计算怎样
公司处理员工违纪目前没有明确时间限制。
当员工违反公司管理规定的，公司当然有权对违纪员工作出处理，原则上是什么时候发现就什么时候处理。但目前，在法律上没有规定公司必须要在什么时间内处理违纪员工的，因此，公司“秋收算账”也是合法的，这也就谈不上处理时限的计算了。
但基于公平、公司稳定发展等因素考虑，公司处理违纪员工，也应当有一个合理的时限的，不应该是想处理就处理，更不应该可以今年不处理明年在处理的。
在这种情况下，公司处理违纪员工的时限，可以参考以下方式决定：
1、公司章程、内部规定有明确规定时间的，应该限定时间内，对违纪员工进行处理。
2、可以参考《劳动争议调解仲裁法》规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。当公司证实或应当证实员工违纪时，可以在一年内对违纪员工进行处理。
3、如果员工所犯错误经过若干年（若干时间）后才被发现并予以证实，可参照《民法典》第188条的规定，最长处理时间可以为20年。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
相关法律规定
《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。 该内容由 冯卫华律师 和 律说律答 共创回答