两兄弟分户口，父母跟谁由父母自行决定，法律并不进行干涉和限制。如果父母在两兄弟分户之前没有独立的户口的，那么在两个儿子之间父母可以选择跟任意一方办理落户手续。但是如果在分户分家之前，父母本身就有独立的户口，那么父母可以选择不跟其中任何一方，而继续独立成户。
【本文关联的相关法律依据】
《户口登记条例》第五条
户口登记以户为单位。同主管人共同居住一处的立为一户，以主管人为户主。单身居住的自立一户，以本人为户主。居住在机关、团体、学校、企业、事业等单位内部和公共宿舍的户口共立一户或者分别立户。户主负责按照本条例的规定申报户口登记。第十九条公民因结婚、离婚、收养、认领、分户、并户、失踪、寻回或者其他事由引起户口变动的时候，由户主或者本人向户口登记机关申报变更登记。